رحم الله الشيخ محمد رفعت رحمة واسعة من عنده وهذا موقف من حياة هذا الشيخ الجليل:
الشيخ محمد رفعت.. رفض قبول المساعدات في آخر أيامه قائلا: «قارئ القرآن لا يهان»
كان يقرأ سورة الكهف في إحدى الليالي، وشعر بغصة في حلقه واحتباس في صوته وظل يجاهد نفسه حتى يستكمل القراءة لكنه عجز عن ذلك، فبكى وأبكى من حوله، ثم اكتشف اصابته بمرض سرطان الحنجرة الذى كان معروفاً حينها بـ«الزغطة» في عام 1943.
وأعلن رئيس تحرير مجلة المصور وقتئذ، عن فتح اكتتاب لعلاج الشيخ وجمع التبرعات، وبالفعل وصل مبلغ التبرعات لأكثر من خمسين ألف جنيه، لكن الشيخ رفعت رفض قبول المساعدات، قائلا إنه غير محتاج، رغم عدم قدرته على دفع تكاليف العلاج، وقال: «شيخ القرآن لا يهان».
بعد معاناة مع المرض، توفي الشيخ محمد رفعت في نفس هذا اليوم هو يوم مولده أيضا في عام 1950.